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不同花色白芨四种DNA条形码的序列分析

作者: 曾丽娜 [1] 刘显义 [1] 石建龙 [2] 梁大勇 [2] 张洁 [1] 张婷婷 [3] 任建国 [3] 刘红美

关键词: 白芨(Bletillastriata) DNA条形码 PCR SNP

摘要:采用CTAB法提取2种花色白芨基因组DNA,选用trnH-psbA、rbcL、ITS、LSU D1-D34种植物DNA条形码通用引物进行PCR扩增,分析黄花、紫花白芨(Bletilla striata)4种DNA条形码的序列,扩增产物纯化后连接T载体并测序,用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对分析.再根据SNP位点设计引物,利用位点特异性PCR扩增进行鉴定.结果表明,4对植物DNA条形码通用引物均能进行扩增,其中trnH-psbA序列没有发现SNP位点、rbcL序列出现2个SNP位点、ITS序列出现62个SNP位点、LSU D1-D3序列出现3个SNP位点.根据LSU D1-D3序列上的2个SNP位点设计的引物DUAN5(5'-TAGTAACGGCGAGCGAAC-3')和JDHH(5'-TTATCAGCTTCCTTGCGCCCG-3')能准确鉴定出黄花白芨,成功获得鉴定黄花白芨的引物序列.


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